新生儿生殖器疱疹主要是在分娩过程中经软产道感染单纯疱疹病毒，约10%是在生后感染，只有4％系宫内感染。感染原因包括病毒宫内播散，胎儿分娩时接触病毒和一些医源性因素，如医护人员带病毒的手，未严格消毒的器械等。孕妇原发性口腔单纯疱疹病毒感染也可使新生儿受累。新生儿单纯疱疹病毒感染约70%由单纯疱疹病毒-2引起，可在生后24～48小时就有异常表现，也可在1个月内出现症状。部分新生儿感染单纯疱疹病毒无临床症状，有症状者可表现为发热、低体温、纳差、皮损、结膜炎、角膜炎，并可伴有黄疸、发绀；累及到中枢神经系统时，可有呕吐抽搐。病情凶险，不经治疗，病死率达65%，存活儿几乎都遗留神经系统损害，如脑积水、失明、听力损害等，只有不到10%的患儿能正常发育。